降低多胎妊娠的风险：单囊胚移植显著降低了多胞胎妊娠的可能性，减少了与多胎妊娠相关的并发症，如早产、低出生体重等。减少孕期并发症：单胎妊娠相比多胎妊娠，母亲发生高血压、糖尿病等孕期并发症的风险较低。
提高新生儿健康状况：单胎婴儿通常具有更好的生长发育条件，减少了新生儿重症监护室的住院率。妊娠成功率可能较低：相比于双囊胚移植，单囊胚移植的妊娠成功率可能略低，尤其是对于年轻且胚胎质量高的患者，这一差异更为明显。提高妊娠成功率：对于某些患者群体，突出表现为年龄较大或胚胎质量一般的患者，双囊胚移植可以增加妊娠的机会。适合多次IVF失败的患者：对于经历过多次IVF周期但未成功的患者，双囊胚移植可能是一个合理的选择，以提高成功怀孕的几率。
增加多胎妊娠的风险：双囊胚移植最显著的风险是增加了多胞胎妊娠的概率，这可能衍生出母婴健康问题，包括早产、低出生体重、妊娠高血压等。可能增加孕期和分娩并发症：多胎妊娠还可能增加母亲孕期并发症的风险，如妊娠糖尿病、高血压疾病等，同步地也可能增加分娩时的复杂性。患者年龄：年轻患者通常有更高的妊娠成功率，即便进行单囊胚移植，其成功率也相对较高。胚胎质量：高质量的胚胎移植成功率更高，所以，如果可用的胚胎质量很好，医生可能会建议单囊胚移植。
既往IVF经历：对于有多次IVF失败经历的患者，医生可能会倾向于推荐双囊胚移植以提高妊娠机会。